З квітня 2023 року Міхаель Аллендорф відповідає за спортивні справи гандбольної команди MT Melsungen. Екс-гравець став спортивним директором клубу, який зазнав важливих змін. Раніше MT Melsungen був занадто залежним від зірок, але зараз виступає як злагоджена команда.

В інтерв'ю Аллендорф підкреслює необхідність перегляду підходів до навантаження на гравців. Він закликає федерації скоротити кількість великих турнірів, особливо в олімпійські сезони, щоб запобігти надмірним травмам та зберегти здоров'я спортсменів.